1.研究国家、国防、高等教育、行业和地方社会经济发展宏观形势与政策，为学校领导和有关单位决策提供参考建议，定期编辑《高等教育形势与宏观政策信息》。
2.组织开展学校发展建设需要的调查研究工作，组织校内调研课题立项、管理、结题、评奖等工作，编辑出版《高教研究与发展规划》期刊（季刊）。
3.研究高等教育教学改革发展的理论、政策和实践问题，负责各级高等教育学会课题的申报、实施和成果推荐工作，组织校内教育研究课题。
4.编辑出版《哈尔滨工程大学学报·教育科学版》内部期刊。
5.结合学校发展开展专题性高等教育研究，每年以高等教育研究所名义形成高水平研究成果。
6.学校学术委员会秘书处的日常运转工作。
7.协调学科建设、人才培养、科学研究、师资队伍建设、国际化办学等工作中学术委员会参与事项的综合协调工作。
8.处内党务、日常行政和综合管理工作，计划、项目及各类文件资料的归档整理工作。
9.处内保密管理工作，保密资料归档和保密安全检查工作，组织保密制度、法规学习贯彻。